A valorização do conhecimento científico faz-se através das ligações que o departamento tem com a indústria, envolvendo serviços técnicos e projetos de I&D aplicados. O departamento assume entretanto a gestão de quatro estruturas de interface: o Laboratório de Análises Químicas (LAQ), o Centro para a Valorização de Resíduos (CVR) , a Rede de Competências para a Bioenergia (CEBio) e o Fibrenamics.